Causa intrínseca
São estas as causas chamadas causas intrínsecas ou emergentes, por emergirem na natureza da coisa, constituírem a sua natureza, o que nasce com a coisa. O cosmológico é distinto do ontológico, o termo é tomado neste último sentido como o de que é feito uma coisa. Esse de que infunde e comunica ser ao ente, e como constitui o seu ser é uma causa intrínseca do mesmo (emergente).
A coisa é feita ex quo (do que) a constitui intrinsecamente. Dividiam os escolásticos a matéria em ex qua, in qua e circa quam. Ex qua significa a matéria constitutiva da coisa; in qua, a em que é introduzida a forma, e circa quam, aquela na qual opera o agente. A matéria ex qua é dividida em transeunte e manente. A matéria ex qua transiens é a matéria que não só é causa material, mas também inclui o termo pelo qual; assim a lenha é matéria ex qua para que o fogo se realize. Não é propriamente a causa material do que se trata. A matéria manente é a causa material que mana no composto (matéria e forma).
A forma (causa formal) é uma causa intrínseca, constituinte do composto, que tem o papel de parte específica, que indica a qüididade, o que a coisa é. Para os pitagóricos, a forma é o logos de proporcionalidade intrínseca do ser, ou melhor, a relação formada entre a disposição harmônica das partes, obedientes à normal dada pela totalidade, pois em todo ser, que é qüididativamente formado, os elementos constituintes da sua estrutura, embora opostos entre si, analogam-se, segundo uma normal dada pela totalidade, e funcionam nesta segundo essa normal, o que constitui a harmonia, que há em todo ser formalmente constituído. Num ser absolutamente simples, cuja estrutura é apenas ele mesmo, sem composições, como o Ser Supremo, sua forma identifica-se com ele mesmo e não é ela um logos de proporcionalidade, mas o próprio logos, sua própria lei, seu próprio princípio, é si mesmo. Este objeto é um livro, porque tem a forma do livro; ou seja, suas partes estão dispostas de modo a constituir o que exige o logos do livro.